Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RprmQ9JJ72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RprmQ9JJ72 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RprmQ9JJ72 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RprmQ9JJ72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms