Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2ird1Q9JI57 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtf2ird1Q9JI57 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf2ird1Q9JI57 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms