Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn19Q9ET38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn19Q9ET38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn19Q9ET38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn19Q9ET38 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn19Q9ET38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn19Q9ET38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cldn19Q9ET38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn19Q9ET38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn19Q9ET38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cldn19Q9ET38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn19Q9ET38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn19Q9ET38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms