Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dkc1Q9ESX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dkc1Q9ESX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dkc1Q9ESX5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dkc1Q9ESX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dkc1Q9ESX5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dkc1Q9ESX5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms