Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem27Q9ESG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem27Q9ESG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem27Q9ESG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms