Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hipk3Q9ERH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hipk3Q9ERH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hipk3Q9ERH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hipk3Q9ERH7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms