Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap29Q9ERB0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snap29Q9ERB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snap29Q9ERB0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap29Q9ERB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap29Q9ERB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snap29Q9ERB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snap29Q9ERB0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms