Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD24

Tceal9, Transcription elongation factor A protein-like 9, mousemouse

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Length 104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal9Q9DD24 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tceal9Q9DD24 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tceal9Q9DD24 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tceal9Q9DD24 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tceal9Q9DD24 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tceal9Q9DD24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tceal9Q9DD24 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms