Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrotQ9DC50 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CrotQ9DC50 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CrotQ9DC50 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CrotQ9DC50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CrotQ9DC50 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CrotQ9DC50 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrotQ9DC50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms