Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Abcb6Q9DC29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb6Q9DC29 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb6Q9DC29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb6Q9DC29 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcb6Q9DC29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms