Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf1Q9DBU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf1Q9DBU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf1Q9DBU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf1Q9DBU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf1Q9DBU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf1Q9DBU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf1Q9DBU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf1Q9DBU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf1Q9DBU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms