Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tysnd1Q9DBA6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tysnd1Q9DBA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tysnd1Q9DBA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tysnd1Q9DBA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tysnd1Q9DBA6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms