Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pop5Q9DB28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pop5Q9DB28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pop5Q9DB28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pop5Q9DB28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pop5Q9DB28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms