Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc54Q9DAL3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc54Q9DAL3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc54Q9DAL3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc54Q9DAL3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms