Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700018B08RikQ9DA83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
1700018B08RikQ9DA83 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.55■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.53■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700018B08RikQ9DA83 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1700018B08RikQ9DA83 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
1700018B08RikQ9DA83 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms