Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmbim4Q9DA39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmbim4Q9DA39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmbim4Q9DA39 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmbim4Q9DA39 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmbim4Q9DA39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms