Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S2

Tmem225, Transmembrane protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem225Q9D9S2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem225Q9D9S2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem225Q9D9S2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem225Q9D9S2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem225Q9D9S2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem225Q9D9S2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms