Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pradc1Q9D9N8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pradc1Q9D9N8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pradc1Q9D9N8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pradc1Q9D9N8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms