Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hm13Q9D8V0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hm13Q9D8V0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hm13Q9D8V0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hm13Q9D8V0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 464.6 ms