Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tvp23bQ9D8T4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tvp23bQ9D8T4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tvp23bQ9D8T4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tvp23bQ9D8T4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms