Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tspan17Q9D7W4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan17Q9D7W4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan17Q9D7W4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan17Q9D7W4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tspan17Q9D7W4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms