Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh2d4aQ9D7V1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh2d4aQ9D7V1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh2d4aQ9D7V1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh2d4aQ9D7V1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms