Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf225Q9D7D1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf225Q9D7D1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnf225Q9D7D1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf225Q9D7D1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf225Q9D7D1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf225Q9D7D1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms