Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6U8

Fam162a, Protein FAM162A, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam162aQ9D6U8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam162aQ9D6U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam162aQ9D6U8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam162aQ9D6U8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam162aQ9D6U8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam162aQ9D6U8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms