Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gins2Q9D600 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gins2Q9D600 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gins2Q9D600 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gins2Q9D600 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gins2Q9D600 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gins2Q9D600 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms