Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp6v1e2Q9D593 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp6v1e2Q9D593 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp6v1e2Q9D593 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms