Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Odf2lQ9D478 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Odf2lQ9D478 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Odf2lQ9D478 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Odf2lQ9D478 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Odf2lQ9D478 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Odf2lQ9D478 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Odf2lQ9D478 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,9 ms