Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hacd2Q9D3B1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hacd2Q9D3B1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hacd2Q9D3B1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hacd2Q9D3B1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hacd2Q9D3B1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms