Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim42Q9D2H5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim42Q9D2H5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim42Q9D2H5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim42Q9D2H5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim42Q9D2H5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms