Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Creb3l4Q9D2A5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Creb3l4Q9D2A5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Creb3l4Q9D2A5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Creb3l4Q9D2A5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Creb3l4Q9D2A5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms