Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ifitm1Q9D103 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm1Q9D103 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm1Q9D103 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm1Q9D103 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms