Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P5

Pygo1, Pygopus homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pygo1Q9D0P5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pygo1Q9D0P5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pygo1Q9D0P5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pygo1Q9D0P5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pygo1Q9D0P5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pygo1Q9D0P5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms