Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem88Q9D0N8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem88Q9D0N8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem88Q9D0N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem88Q9D0N8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms