Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prpsap1Q9D0M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prpsap1Q9D0M1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpsap1Q9D0M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpsap1Q9D0M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpsap1Q9D0M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms