Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssbp2Q9CYZ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ssbp2Q9CYZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp2Q9CYZ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms