Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ssbp1Q9CYR0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17,02■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17,01■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ssbp1Q9CYR0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,3
Ssbp1Q9CYR0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Ssbp1Q9CYR0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,9 ms