Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mis12Q9CY25 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mis12Q9CY25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mis12Q9CY25 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Mis12Q9CY25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms