Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bud23Q9CY21 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bud23Q9CY21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bud23Q9CY21 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bud23Q9CY21 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bud23Q9CY21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bud23Q9CY21 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms