Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sgo1Q9CXH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sgo1Q9CXH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sgo1Q9CXH7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sgo1Q9CXH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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