Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gnpda2Q9CRC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gnpda2Q9CRC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gnpda2Q9CRC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gnpda2Q9CRC9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms