Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klhl28Q9CR40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Klhl28Q9CR40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl28Q9CR40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl28Q9CR40 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms