Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd9Q9CR00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd9Q9CR00 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd9Q9CR00 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd9Q9CR00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd9Q9CR00 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms