Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PclafQ9CQX4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PclafQ9CQX4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PclafQ9CQX4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PclafQ9CQX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PclafQ9CQX4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PclafQ9CQX4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PclafQ9CQX4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PclafQ9CQX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200 ms