Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ykt6Q9CQW1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ykt6Q9CQW1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ykt6Q9CQW1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ykt6Q9CQW1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms