Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retreg3Q9CQV4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retreg3Q9CQV4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retreg3Q9CQV4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retreg3Q9CQV4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retreg3Q9CQV4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg3Q9CQV4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retreg3Q9CQV4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg3Q9CQV4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retreg3Q9CQV4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms