Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mri1Q9CQT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mri1Q9CQT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mri1Q9CQT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mri1Q9CQT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms