Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riok2Q9CQS5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Riok2Q9CQS5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Riok2Q9CQS5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Riok2Q9CQS5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Riok2Q9CQS5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms