Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc2Q9CQP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc2Q9CQP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc2Q9CQP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms