Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,69■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17,64■□□□□ 0,42
Tmed6Q9CQG0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17,61■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17,59■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,41
Tmed6Q9CQG0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,58■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Tmed6Q9CQG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,1 ms