Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQF4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQF4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQF4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQF4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQF4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CQF4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQF4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CQF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CQF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQF4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQF4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CQF4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQF4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQF4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9CQF4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CQF4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQF4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQF4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQF4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CQF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQF4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQF4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CQF4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQF4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CQF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQF4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CQF4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms